自分もバージョン違いか何かでデータ復元ができなくなりました。
大事な写真を外付けSSDにバックアップしていたものを
どうしようかと思って散々試行錯誤しましたが
以下の方法で普通に読み込めました。
MFI ファイル (.mfi)を
ファイル解凍圧縮ソフトのLhaForgeを使って解凍。
容量が大きければそれだけ時間もかかりますが
これで無事に他のソフトでは読み込めなかった
圧縮ファイルがフォルダ階層もそのままで
キレイに解凍できました。
純正ツールでは手が届かないあたりも
カバーしてくれると思ってMiniTool ShadowMakerを使いましたが
これでは使い物にならないと思います。