再投稿です。動画をMP4でメインで使用しています。みなさんの言うようなバグもいくつかありました。特に動画ソースがDLファイルだとWindows Media Playerや他のMPlayerで問題なく再生ができるのだが、Freemakeで変換するとデコーダーの相性が悪いせいか（結構デリケートなデコーダーです）ソフトが落ちるか、変換後の動画にフラッシュバックやブロックノイズ、紙芝居のようなカクカクした動画になってしまいます。対策として自分は『MediaCoder』で一度動画と音声を変換し直してFreemakeを使うと問題なく変換できるようになります。主にDVDの製作に使用していますが、4,5時間の動画を1時間足らずで変換してくれて、しかも高画質な点が気に入っています。